Ik ontwikkel op maat gemaakte bioinformatica scripts en pipelines in python
Over deze dienst
Ik ontwikkel op maat gemaakte bioinformatica scripts & pipelines in Python
Heb je moeite met biologische of bioinformatica taken?
Zoek niet verder! Ik bied deskundige Python scripting en reproduceerbare workflows op maat van jouw specifieke behoeften. Of je nu werkt aan sequentie-analyse, RNA-Seq pipelines, of geavanceerde data visualisatie, ik maak schone, efficiënte en goed gedocumenteerde code die je tijd bespaart en je onderzoek versnelt.
De diensten omvatten:
- Sequentie-analyse (DNA, RNA, eiwit)
- NGS/RNA-Seq workflows: QC, uitlijning, DE-analyse
- Genomica: variant calling, genome assembly, annotatie
- Transcriptomics & metagenomics
- Fylogenie, netwerkanalyse, systeembiologie
- Machine learning voor classificatie & clustering
- Publicatieklare plots (Matplotlib, Seaborn, Plotly)
Vaardigheden & tools: Python (Biopython, Pandas, scikit-learn), Bash, Linux, Jupyter, Docker/Conda, Snakemake/Nextflow, GitHub.
Waarom voor mij kiezen?
- Op maat gemaakte oplossingen voor jouw project
- Reproduceerbare omgevingen (Conda/Docker)
- Levering via GitHub & testdata inbegrepen
- Tijdige levering + vertrouwelijkheid
Ondersteuning na levering
- Neem contact met me op voordat je bestelt om je project te bespreken!
Domein:
Machine learning
•
Tijdreeksanalyse
Expertise:
Classificatie
•
Beslissingsbomen
•
Voorspellende analyse
Programmeertaal:
Python
Tools:
Jupyter-notitieboek
•
Stata
Technologie:
Python
•
scikit-learn
•
SPSS
•
Pandas
•
Stata
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
V: Wat heb je nodig om te beginnen?
A: Invoersbestanden (of sample), verwachte outputs, organisme (indien relevant), en analyse doel.
Q: Werkt de code op mijn computer?
A: Ja. Ik lever omgevingsbestanden (Conda/Docker) voor eenvoudige setup.
Q: Kan je grote datasets analyseren?
A: Ja. Platinum pakketten ondersteunen HPC/cluster/cloud pipelines (neem eerst contact op).
Q: Bied je biologische interpretatie?
A: Basisbiologische inzichten zijn inbegrepen. Voor publicatieklare rapporten, vraag een aangepaste offerte aan.

