Ik voer transcriptomics en qsar-modellering uit
Researcher in computationele biologie en bioinformatica | Multi-omics | Python, R
Over deze dienst
Ik bied grondige, publicatieklare transcriptomics-analyse van ruwe count matrices tot biologische interpretatie met DESeq2, WGCNA en pathway enrichment tools in R en Python.
Ik bied:
- Differentiële expressie-analyse: DESeq2, limma, edgeR
- WGCNA: constructie van co-expressienetwerken, identificatie van hub-genen, trait correlatie
- Pathway enrichment: GO, KEGG, Reactome met clusterProfiler
- ssGSEA: immuuncel infiltratie en gen set scoring
- GEO dataset handling: data ophalen, preprocessing, normalisatie
- Visualisatie: volcano plots, heatmaps, PCA, pheatmap, ggplot2
- Integratie met drug discovery of network pharmacology pipelines
Vaardigheden:
- R · DESeq2 · WGCNA · limma · clusterProfiler · ggplot2 · pheatmap
- Python · Pandas · matplotlib · seaborn
- GEO · TCGA · KEGG · Reactome · GO
Waarom voor mij kiezen:
- Praktijkervaring met echte COPD en kanker transcriptomics datasets
- Schoon, geannoteerde R scripts geleverd bij elke opdracht
- Figuren volgens journal submission standaarden
- Responsief en detailgericht gedurende het hele project
- Comfortabel met het verwerken van rommelige, real-world GEO datasets
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Ik heb geen specifiek script in gedachten, alleen een probleem. Kun je nog steeds helpen?
Ja — stuur me een bericht met je data en waar je achter probeert te komen, en ik stel de juiste aanpak voor voordat je bestelt. Je hoeft de technische details niet zelf te weten.
Houd je mijn data en onderzoek vertrouwelijk?
Ja. Je data, onderzoeksidee en resultaten worden nooit gedeeld, hergebruikt of besproken met iemand anders. Dit blijft strikt tussen ons.
Ik ben niet erg ervaren met coderen — begrijp ik het uiteindelijke script?
Ja. Ik schrijf nette, commentaar gevulde code en leg de output uit in gewone taal, niet alleen technische jargon. Je begrijpt wat het script doet en waarom.
Kun je werken met mijn specifieke dataset/database (GEO, ChEMBL, PDB, NCBI, enz.)?
Ja, ik werk regelmatig met alle grote biologische databases. Vermeld gewoon welke in je bericht en ik bevestig dat ik het aankan.
Heb je mijn volledige dataset nodig voordat ik bestel, of kan ik die na verzending sturen?
Dat kan allebei. Als je me eerst een voorbeeld of beschrijving van je data stuurt, kan ik de scope en planning bevestigen voordat je bestelt — zo voorkom je verrassingen.
Is dit alleen voor studenten, of werk je ook met onderzoekers en bedrijven?
Ik werk met iedereen — studenten, PhD-onderzoekers, professors en bedrijven. De scope en prijsopties passen zich aan de complexiteit van jouw project aan.

