Ik voer rna seq, dge analyse, wgcna en transcriptomics uit

Sommige informatie is automatisch vertaald.
Samskruthi J

India

Ik spreek Kannada, Engels, Hindi

Researcher in computationele biologie en bioinformatica | Multi-omics | Python, R

Bioinformatica-expert gespecialiseerd in Python, R en Bash scripting, met een sterke focus op onderzoeksgedreven computationele oplossingen. Expertise omvat machine learning, multi-omics integratie, d...
Lees meer
Over deze dienst

Ik bied grondige, publicatieklare transcriptomics-analyse van ruwe count matrices tot biologische interpretatie met DESeq2, WGCNA en pathway enrichment tools in R en Python.

Ik bied:

  • Differentiële expressie-analyse: DESeq2, limma, edgeR
  • WGCNA: constructie van co-expressienetwerken, identificatie van hub-genen, trait correlatie
  • Pathway enrichment: GO, KEGG, Reactome met clusterProfiler
  • ssGSEA: immuuncel infiltratie en gen set scoring
  • GEO dataset handling: data ophalen, preprocessing, normalisatie
  • Visualisatie: volcano plots, heatmaps, PCA, pheatmap, ggplot2
  • Integratie met drug discovery of network pharmacology pipelines

Vaardigheden:

  • R · DESeq2 · WGCNA · limma · clusterProfiler · ggplot2 · pheatmap
  • Python · Pandas · matplotlib · seaborn
  • GEO · TCGA · KEGG · Reactome · GO

Waarom voor mij kiezen:

  • Praktijkervaring met echte COPD en kanker transcriptomics datasets
  • Schoon, geannoteerde R scripts geleverd bij elke opdracht
  • Figuren volgens journal submission standaarden
  • Responsief en detailgericht gedurende het hele project
  • Comfortabel met het verwerken van rommelige, real-world GEO datasets
Lees meer
perform rna seq, dge analysis, wgcna, and transcriptomics
Volledig scherm
perform rna seq, dge analysis, wgcna, and transcriptomics

Technologie:

Excel

•

Google Sheets

•

Jupyter-notitieboek

•

Pandas

+1 meer

Type analyse:

Kwantitatieve analyse

•

Kwalitatieve analyse

+1 meer

Expertise:

Statistieken

Programmeertaal:

Python

•

R

Mijn portfolio

Gerelateerde tags