Ik schrijf python- en r-scripts voor bio-informatica

Ik schrijf Python-scripts voor problemen in biologie en bioinformatica

Biologische data zouden je onderzoek niet mogen vertragen.

Ik ben een onderzoeker in computationele biologie met praktische ervaring in het bouwen van Python-pijplijnen voor drug discovery, transcriptomics en machine learning, inclusief twee eerste auteurs manuscripten in voorbereiding. Ik schrijf schone, goed gedocumenteerde Python-scripts die echte bioinformatica-problemen aanpakken, zodat je resultaten krijgt die je daadwerkelijk kunt gebruiken en begrijpen.

Ik bied aan:

• Sequentie-analyse: DNA-, RNA- en eiwituitlijning en feature-extractie
• Genomische data verwerking: NGS-data handling, variantannotatie en assemblage
• Structurele bioinformatica: eiwitstructuur ophalen, analyseren en visualiseren
• Fylogenetica: analyse van evolutionaire relaties en boomconstructie
• Systeembiologie: padmapping en analyse van biologische netwerken
• Data visualisatie: publicatieklare grafieken voor biologische en genomische data
• Metagenomics: microbieel gemeenschapprofiel en diversiteitsanalyse
• Transcriptomics: genexpressie-analyse en workflows voor differentiële expressie
• Machine learning: bioactiviteit voorspelling, sampleclassificatie en QSAR-modellering

Vaardigheden:

• Python · Biopython · NumPy · Pandas