Ik zal differential expressie- en verrijkingsanalyse in R uitvoeren
Bioinformatica en Sequencing Data Analyse
Over deze dienst
Professionele bioinformatica voor downstream data-analyse en publicatieklare visualisaties in R.
Ik verwerk ruwe genexpressie-tellen matrices, microarray-tabellen of vooraf berekende DEG-lijsten om strikte statistische tests uit te voeren en publicatieklare figuren te maken voor toonaangevende tijdschriften.
Pakketten & prijzen: - Basic (€10 / 2 dagen): 1 contrast DEG-analyse (DESeq2/limma/edgeR). Inclusief Volcano-plot (EnhancedVolcano), sample PCA-plot, top DEG-heatmap (pheatmap), samenvattende tabellen en reproduceerbaar R-script. - Standard (€20 / 4 dagen): 1 contrast DEG + Functionele verrijking. Alle Basic-opleveringen plus GO (BP/MF/CC) en KEGG-pad verrijkingsanalyse via clusterProfiler. Dotplots, barplots en cnetplots inbegrepen. - Premium (€40 / 7 dagen): Tot 2 contrasten DEG + GO, KEGG en GSEA verrijking. Sterk aangepaste publicatiefiguren (PDF vector & 600 DPI PNG) met kleurpaletten, genannotaties en volledig gecommentarieerd R-script.
Invoervereisten: Ruwe tel-matrix of genormaliseerde expressietabel met bijbehorende metadata-sheet voor monsters (groepen en covariaten).
Afbakening van de scope: Downstream analyse uitsluitend; onderzoeksdoeleinden. Snelle doorlooptijd en duidelijke Engelse samenvatting inbegrepen.
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Welk dataformaat moet ik aanleveren?
Geef alsjeblieft een expressie-tellijst (ruwe tellingen voor DESeq2 of genormaliseerde expressie voor limma) samen met een sample metadata-bestand waarin experimentele condities en biologische replicaten staan vermeld. CSV, TSV of Excel-formaat wordt geaccepteerd.
