Ik zal bioinformatica, ngs, rnaseq en transcriptoomanalyse doen

Hallo, ik ben Shohel Islam, een bioinformaticus en biotechnoloog. Ik voer WGS, RNA-seq, 16s rRNA-seq, ncRNA-seq (miRNA, lncRNA), en Microarray data analyse uit in Linux terminal en RStudio. Als je moeite hebt met het begrijpen van NGS-gerelateerde projecten, ben ik hier om je te helpen. Ik heb gewerkt aan verschillende onderzoeksartikelen en weet welk soort data nodig is.

Enkele voorbeelden van mijn onderzoeksartikelen:

1. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0317008
2. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0319952
3. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0319176
4. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0309353
5. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0298543

Je kunt mijn diensten gebruiken voor:

• Data ophalen uit SRA-database / Gepersonaliseerde RNA-Seq ruwe reads.
• Kwaliteitscontrole van de ruwe reads (Fastqc).
• Trimmen van slechte kwaliteit reads en adapters.
• Aligneren van de ruwe reads.
• Genereren van de feature count matrix.
• Normaliseren van de data (RPKM/FPKM/TPM).
• Differentiële analyse van genen.
• Up- en downregulerende genenlijsten.
• Niet-coderende RNA voorspelling
• Variant calling en annotatie.
• Spatiale transcriptomics analyse

Stuur me eerst een bericht om te bevestigen dat ik beschikbaar ben binnen jouw tijdsbestek en dat ik kan doen wat je nodig hebt. Dank je wel!