Ik bouw een op maat gemaakte bioinformatics tools in Python
Over deze dienst
Wil je biologische data sequences, mutaties of eiwitstructuren analyseren, maar wil je niet wekenlang scripts schrijven? Ik ontwikkel Python bioinformatics tools die de analyse uitvoeren en je schone, bruikbare output geven.
Wat ik heb gebouwd: een CRISPR gen editing simulator (857 PAM-sites gescand op het HBB-gen), een COVID-variant mutatie tracker (Omicron BA.3.2, 91 mutaties geïdentificeerd), een eiwitstructuur analyzer (sikkelcel E6V en BRCA1 C61G getest), en een interactie explorer voor geneesmiddelen en targets (Imatinib gekoppeld aan 45 targets).
Portfolio: github.com/CodeXSourabhsingh
Mijn stack: Python, Biopython, Pandas, NumPy, MySQL, Streamlit, Py3Dmol, NCBI Entrez, RCSB PDB, ChEMBL.
Wat je krijgt:
- Werkende code, geen pseudocode
- Echte data uit openbare databases, geen speelgoedvoorbeelden
- Schone structuur, gedocumenteerd
- 30 dagen bugfixes
Stuur me een korte omschrijving van welke biologische data je hebt, welke vraag je probeert te beantwoorden, en welk output je nodig hebt. Ik reageer binnen 24 uur met een offerte en planning.
Technologie:
Python
•
Overige
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Met wat voor soort biologische data kun je werken?
DNA/RNA sequences (FASTA), eiwitstructuren (PDB), genexpressietabellen (CSV), variantgegevens (VCF), en elke openbare bio database via API.
Lever je de data aan?
Nee. Jij brengt de data of de biologische vraag. Ik haal indien nodig data uit openbare bronnen — NCBI, PDB, ChEMBL.
Kun je een tool bouwen voor mijn specifieke organisme?
Ja, zolang er referentiedata voor bestaan. Universele tools zijn mijn specialiteit — dezelfde engine, elk organisme.
Hoe weet ik dat de tool werkt?
Ik stuur een schermopname van de werking op echte data. Je kunt het testen voordat het definitief wordt opgeleverd.
Wat maakt jouw werk anders dan dat van andere developers?
Ik heb 5 bio-data applicaties gedeployed in 17 dagen. Mijn tools draaien op echte data van NCBI, ChEMBL en PDB — en één is publiekelijk gevalideerd door de CEO van een AI-native eClinical bedrijf.

