Door categorieën bladeren
Ontdekken
Fiverr Pro
Nederlands
$
USD
Ik analyseer je 16s microbiome data met qiime2 bioinformatics
Hallo, mijn naam is Steven Criollo. Ik ben een biotechnologie-ingenieur met een masterdiploma in bio-informatica en biostatistiek. Ik geef les in bio-informatica en werk ook als bioinformaticus voor e...
Over deze dienst
Soorten analyse:
BASISANALYSE:
- Data kwaliteit controle.
- Denoising en clustering (ASV).
- Taxonomische classificatie.
- Relatieve abundantie.
- Fylogenetische boom.
STANDAARDANALYSE:
Basis analyse +
- Rarefactiecurves.
- Alpha diversiteit analyse: Shannon index, waargenomen kenmerken, Faith's fylogenetische diversiteit, Pielou's gelijkmatigheid.
- Beta diversiteit analyse: Jaccard afstand, Bray-Curtis afstand, unweighted UniFrac afstand, weighted UniFrac afstand.
- Ordinatiemethoden: Principal Coordinates Analysis (PCoA), Uniform Manifold Approximation and Projection (UMAP).
- Differentiële abundantie test met ANCOM-BC.
- Statistische significantietests: Kruskal-Wallis, PERMANOVA (ADONIS), ANOSIM, PERMDISP.
PREMIUMANALYSE:
Standaard analyse +
- Enzymatische reacties (EC).
- Genen (KO / KEGG Orthology).
- Metabole routes (MetaCyc).
- Vergelijkende analyse.
Opmerkingen:
*De pakketten Standaard en Premium vereisen informatie over de experimentele groep en minimaal 3 biologische replicaten per groep om diversiteit en statistische analyses uit te voeren.
*De vermelde prijs is per sample. Kortingen zijn beschikbaar voor projecten met meerdere samples.
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Hoe ontvang ik mijn resultaten?
Je resultaten worden geleverd via een cloud opslaglink met alle bestanden die tijdens de analyse zijn gegenereerd, inclusief QIIME2-bestanden (.qza/.qzv), publicatieklare figuren, tabellen en een HTML-rapport met een stapsgewijze uitleg van de analyse en een duidelijke, makkelijk te begrijpen presentatie van alle resultaten.
