Ik voer 100 ns 33 analyse moleculaire dynamica-simulaties uit met GROMACS
Biotechnoloog, CADD Bioinformatics en wetenschappelijk onderzoek, IP-onderzoek
Over deze dienst
Met GROMACS bied ik simulaties en een uitgebreide 33-analyse suite, afhankelijk van de geschiktheid van het systeem.
Wat je krijgt:
- Structurele stabiliteit: RMSD, RMSF, radius of gyratie (Rg), SASA en DSSP.
- Moleculaire interacties: Waterstofbruggen, zoutbruggen, hydrofobe contacten, ProLIF vingerafdrukken, afstands-, hoek- en dihedraalanalyses.
- Binding energie: MM-PBSA en MM-GBSA.
- Geavanceerde analyse: PCA, DCCM, trajectclustering, free energy landscape (FEL) en Ramachandran analyse.
- Extra analyses: QC, PBC-centering, hydratiedynamiek, RDF, MSD, ruimtelijke dichtheid, zakdynamiek, interfacegebied, vormdescriptors en representatieve structuren, plus gespecialiseerde analyses indien van toepassing.
- Outputs: Ruwe simulatiebestanden, numerieke data, analyseplots en verwerkte structuren/trajecten waar nodig.
Interactief HTML-rapport: $300 extra. Bekijk een voorbeeld: https://sujay-19m.github.io/BTGenZ-Molecular-Dynamics-Scientific-Report/
Wil je langere simulaties, moleculaire docking, QSAR of geïntegreerde CADD-diensten? Stuur me gerust een bericht voor aangepaste prijzen voordat je bestelt.
Domein:
Overige
Expertise:
Overige
Programmeertaal:
Python
Tools:
Overige
Technologie:
Overige
Modellen en methoden:
Overige
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Ontvang ik alle 33 analyses voor elke simulatie duur, inclusief 1 ns of 100 ns?
Ja. Elke standaard MD-simulatiepakket bevat de volledige 33-analyse suite, ongeacht of je kiest voor 1 ns, 100 ns of een langere duur. De toepasbaarheid van de analyses hangt af van je moleculaire systeem en onderzoeksdoel.
Kan ik alleen geselecteerde analyses aanvragen in plaats van alle 33?
Ja. Aangepaste analysepakketten zijn beschikbaar als je specifieke resultaten nodig hebt. Je moet minimaal 13-16 analyses kiezen. Als je meer dan 16 analyses wilt, vraag dan naar onze bundelpakketten voor betere waarde.
Heb je een prijstabel voor simulatie duur en aangepaste analyses?
Ja. We hebben een gedetailleerde prijstabel voor simulatie duur en individuele analyse modules. Stuur me een bericht voordat je bestelt als je een aangepaste combinatie of een simulatie buiten de genoemde pakketten nodig hebt.
Welke deliverables ontvang ik?
Je ontvangt ruwe simulatie-uitvoer, numerieke analyseto data, plots en verwerkte structuren of trajecten waar nodig. Een interactief wetenschappelijk HTML-rapport is apart beschikbaar voor $300. Bekijk een voorbeeld: https://sujay-19m.github.io/BTGenZ-Molecular-Dynamics-Scientific-Report/
Bied je moleculaire docking, QSAR of geïntegreerde CADD-diensten aan?
Ja. Naast GROMACS-gebaseerde moleculaire dynamica bied ik ook moleculaire docking, QSAR-modellering en geïntegreerde CADD-diensten aan. Stuur me een bericht voordat je bestelt, zodat we je onderzoeksbehoeften, scope, prijzen en levertijd kunnen bespreken.

