Ik voer moleculaire dynamica simulatie, pathway ontwerp, dft, qsar uit

Ik help je met in silico drug discovery met behulp van industry-standard tools zoals GROMACS, ORCA, AutoDock, Schrödinger en Python-gebaseerde cheminformatics.

Deze dienst omvat onder andere:

Moleculaire docking (Proteïne-Ligand) met Glide/MOE/AutoDock

MD simulatie in GROMACS en 100 ns van een complex in slechts ~6 uur (GROMACS tot 5000 ns)

• RMSD
• RMSF
• SASA
• RG
• H-Bond
• DCCM
• PSA
• PCA
• DSSP
• FEL

QSAR modellering

• 2D/3D
• IC50/pIC50 regressie
• Descriptor optimalisatie

DFT berekeningen:

• HOMO-LUMO gap, orbitalen, ESP-kaarten
• Geometrie optimalisatie, IR-frequenties
• UV/Vis (TD-DFT), fluorescentie

Pharmacophore modellering en Virtual Screening

Binding energie berekeningen

• MM-GBSA
• MM-PBSA

3D/2D visualisatie van binding interacties van Proteïne-Ligand

Optioneel:

• Methode
• Resultaat- en discussie sectie voor publicatie/thesis

Je ontvangt:

• .pdb/.xyz/.csv bestanden
• geschreven analyse
• Score sheets + grafieken
• 300/500/600dpi afbeeldingen van interacties

Of je nu een PhD/MS student, academisch onderzoeker of industrie wetenschapper bent, ik lever snelle, nauwkeurige resultaten met visuals van publicatiekwaliteit.

Neem contact met me op voordat je bestelt om te zorgen dat je targets en liganden compatibel zijn met de tools