Ik voer bioinformatica data-analyse en rna seq pipelines uit
Over deze dienst
Welkom bij mijn Bioinformatics & RNA-Seq Analyse Service!
Ben je op zoek naar een betrouwbare computationeel bioloog om je ruwe genomische data om te zetten in bruikbare biologische inzichten? Met een M.Sc. in Life Sciences (Botanie) en gespecialiseerde certificeringen in Data Science en AI in Pharma, overbrug ik de kloof tussen complexe biologie en geavanceerde data-analyse.
Wat ik aanbied (mijn analyseproces):
- Quality Control (QC): beoordeling en trimming van ruwe reads met FastQC en fastp.
- Sequence Alignment: Zeer nauwkeurige mapping naar referentiegenomen met HISAT2 / STAR.
- Quantificatie: Read telling en genereren van genexpressiematrices met FeatureCounts.
- Differentiële genexpressie (DGE): Statistische analyse met DESeq2 (R).
- Data Visualisatie: Hoogwaardige grafieken klaar voor publicatie (Volcano plots, Heatmaps, PCA plots).
Mijn tech stack:
- Linux CLI & Bash scripting
- Python (Pandas, NumPy)
- R & RStudio
- Bioinformatics tools (SRA Toolkit, Samtools)
Waarom voor mij kiezen? In tegenstelling tot gewone programmeurs heb ik een diepgaand begrip van biologische datasets. Ik lever schone, goed gedocumenteerde en geautomatiseerde pipelines met focus op nauwkeurigheid.
Let op: stuur me een bericht voordat je een bestelling plaatst.
Programmeertaal:
Python
•
R
•
SQL
Technologie:
Excel
•
Jupyter-notitieboek
•
Power BI
•
Tableau
Expertise:
Algoritmes
•
Statistieken
•
Clusteranalyse
Tools:
RStudio
•
Google Colab
•
Microsoft Excel
