Ik doe homology modelling, moleculaire docking en MD-simulaties

Versnel je onderzoek met professionele computational drug discovery diensten. Als PhD-onderzoeker in Structural Bioinformatics bied ik grondige, publicatieklare simulaties en analyses op maat van jouw specifieke biologische doelen.

Wat ik aanbied:

1. Consultatie: Bespreking over mogelijke routes om taken op te lossen.
2. Gedetailleerde methodologie: Ingewikkeldheden van inputs, methoden en tools.
3. Homology Modeling: Hoogwaardige 3D-structuurvoorspelling (AlphaFold2/Modeller) met validatie (Ramachandran, ERRAT, Verify3D).
4. Moleculaire Docking: Uitgebreide Protein-Ligand, Protein-Protein en Protein-DNA docking met AutoDock Vina, MoleDock of HADDOCK.
5. MD Simulaties (GROMACS): Geavanceerde simulaties van complexen. Ik lever RMSD, RMSF, Radius of Gyration, H-bronstabiliteit en SASA-plots.
6. Binding Energie: Nauwkeurige affiniteit berekeningen met MMPBSA/GBSA methoden.
7. QSAR & ML: Machine Learning modellen om activiteit en toxiciteit van verbindingen te voorspellen.

Waarom met mij werken? Ik draai niet alleen software; ik produceer oplossingen voor complexe bioinformatics vraagstukken.

Je ontvangt:

• Hoge resolutie, 3D visualisatiebeelden.
• Grafieken en datatabellen van publicatiekwaliteit.
• Gedetailleerde methodologierapporten voor je manuscripten.