RNA-seq data analyseren en een duidelijk expressierapport leveren
Bioinformatica analist, Genomics Data Analyse
Over deze dienst
Ik bied bioinformatica-advies voor RNA-seq en transcriptomics projecten.
Ik kan je helpen bij het plannen van een analyse, je workflow beoordelen, resultaten interpreteren en praktische problemen in genomische data-analyse oplossen. Mijn onderzoekservaring omvat long-read en short-read RNA-seq, ontdekking van nieuwe isoformen, alternatieve splicing, transcriptannotatie, genexpressie-analyse en reproduceerbare scripting.
Ik werk met Python, R, Bash, Linux, Jupyter Notebook, Pandas en RStudio.
Ik kan je ondersteunen met:
-RNA-seq studieontwerp en kwaliteitscontrole strategie
-Differentiële genexpressie analyse en interpretatie
-Long-read transcriptome en isoform analyse
-Alternatieve splicing en transcriptannotatie
-Data verwerking met Python of R
- Figuren, tabellen en bioinformatica rapporten begrijpen
-Verbeteren van een bestaande analyse workflow
Neem contact met mij op voordat je een bestelling plaatst, vooral als je project raw sequencing data bevat of een strakke deadline heeft. Stuur een korte beschrijving van je project, je huidige analysefase en de vragen die je wilt bespreken.
Ik bied duidelijke, praktische aanbevelingen op maat van jouw onderzoeksvraag.
Technologie:
Excel
•
Jupyter-notitieboek
•
Pandas
•
RStudio
Expertise:
Experimentontwerp
•
Algoritmes
•
Overige
Programmeertaal:
Python
•
R
