Ik voer RNA-seq bioinformatica analyse uit en lever een duidelijk rapport

Ik bied duidelijke en reproduceerbare bioinformatica analyse voor RNA-seq en transcriptomics projecten.

Het Basic pakket is voor verwerkte RNA-seq data, zoals een count matrix, expressietabel, transcriptannotatie of andere analyse-klare bestanden. Het dekt tot 12 samples en één gedefinieerde vergelijking.

Afhankelijk van je data en onderzoeksvraag kan de analyse onder andere omvatten:

-Data controle, filtering en normalisatie

-PCA en sample clustering

-Differentiële genexpressie analyse

-DEG-tabellen en expressiesamenvattingen

-Heatmaps, volcano plots en andere visualisaties

-Transcript- of isoformniveau analyse voor geschikte datasets

-Reproduceerbare scripts in R of Python

-Een beknopte samenvatting van methoden en belangrijkste resultaten

Leveringen kunnen verwerkte tabellen, figuren, scripts en een samenvatting van de resultaten omvatten.

Neem contact met mij op voordat je bestelt. Stuur je organisme, aantal samples, experimentele groepen, beschikbare bestandstypen en hoofdonderzoeksvraag.

Raw FASTQ-verwerking, meer dan 12 samples, meerdere vergelijkingen, complexe ontwerpen, lang-lees isoform ontdekking en functionele verrijking zijn niet inbegrepen in het Basic pakket. Deze kunnen worden besproken als een maatwerk project.