Ik bouw fylogenetische bomen en voer sequentie-alignanalyse uit
Bioinformatica specialist: eiwitmodellering, fylogenetica en genoomanalyse
Over deze dienst
Wil je laten zien hoe soorten, genen of pathogeenstammen evolutionair met elkaar verbonden zijn en dit onderbouwen met een goed gebouwde boom? Ik align je sequenties en maak een nette, publicatieklare fylogenetische boom, met een geschreven interpretatie van wat het laat zien.
Wat je ontvangt:
- Multiple Sequence Alignment (MSA) met Clustal Omega
- Constructie van fylogenetische boom met MEGA
- Identificatie van SNPs, mutaties en divergentiestappen
- Nette, gelabelde boomafbeelding klaar voor rapporten of artikelen
- Geschreven uitleg van de getoonde evolutionaire relaties
Ideaal voor: pathogenlijnstudies, vergelijkende genomica-opdrachten, onderzoek naar evolutie van eiwitfamilies.
Hoe we communiceren: Voornamelijk via Fiverr-berichten. Stuur je sequenties (FASTA, minimaal 3 nodig) en ik regel de rest.
Technologie:
Google Analytics
•
Google Data Studio
Type analyse:
Beschrijvende analyse
•
Voorspellende analyse
Expertise:
Voorspelling
•
waarschijnlijkheid
•
wiskunde
Programmeertaal:
Python
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Hoeveel sequenties kan je verwerken?
Basic/standaard zijn beperkt voor snelheid; stuur me een bericht voor grotere datasets.
In welk boomformaat wordt geleverd?
Newick-formaat plus gerenderde PNG/PDF.
