Ik voorspel en visualiseer 3d-eiwitstructuren met alphafold en psipred
Bioinformatica specialist: eiwitmodellering, fylogenetica en genoomanalyse
Over deze dienst
Heb je moeite om een schone, verdedigbare 3D-eiwitstructuur te krijgen voor je scriptie, paper of opdracht? Ik neem je sequentie en zet het om in een nauwkeurige structuur met een eenvoudige uitleg van wat het betekent, niet alleen een afbeelding.
Wat je ontvangt:
- Tertiaire structuurvoorspelling met AlphaFold
- Secundaire structuurvoorspelling met PSIPRED (alpha helixen, beta vouwen)
- Structuurvisualisatie met Discovery Studio Visualizer
- ORF-identificatie en DNA-naar-eiwit vertaling (ExPASy)
- Validatie van structurele kwaliteit
- Geschreven samenvatting die de structuur uitlegt in begrijpelijke termen
Ideaal voor: scriptiehoofdstukken, onderzoeksartikelen, coursework of iedereen die zowel de visuele als de interpretatie nodig heeft.
Hoe we communiceren: Voornamelijk via Fiverr berichten. Ik deel voortgang en concepten voor feedback. Stuur me je sequentie of onderzoeksdoel voordat je bestelt, en ik help je het juiste pakket te kiezen.
Technologie:
Excel
•
SmartPLS
•
Overige
Expertise:
Algoritmes
•
Voorspelling
•
wiskunde
•
Statistieken
•
Overige
Programmeertaal:
Python
•
R
•
MATLAB
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
In welk formaat moet ik mijn sequentie sturen?
FASTA heeft de voorkeur; UniProt/PDB ID werkt ook.
Ontvang ik het ruwe structuurbestand?
Ja, inbegrepen bij elk pakket.
Schrijf je aangepaste scripts of code?
Nee — resultaten worden geleverd met behulp van gevestigde tools (AlphaFold, PSIPRED, Discovery Studio Visualizer) in plaats van aangepaste code.
Hoe communiceren we tijdens het project?
Voornamelijk via Fiverr berichten; een live gesprek is meestal niet nodig voor de meeste verzoeken.

