Ik voer RNA-seq en bioinformatica data-analyse uit

Ik bied bioinformatica ondersteuning voor RNA-seq en transcriptomische projecten, inclusief kwaliteitscontrole, read trimming, transcriptie kwantificatie, gen-telling, de novo transcriptome assemblage en differentiële expressie analyse. Ik maak ook PCA-plots, heatmaps, volcano plots, MA-plots, genormaliseerde count-tabellen en figuren voor specifieke genen van interesse. Ik werk in R, Python en Linux omgevingen en heb ervaring met tools zoals DESeq2, Salmon, tximport, featureCounts en fastp. Elk project wordt aangepast aan het organisme, het experimentele ontwerp, beschikbare referentiebestanden en de specifieke vragen die je probeert te beantwoorden.