Ik voer moleculair docking uit en eiwit-ligand interactie analyse
Over deze dienst
Ben je op zoek naar betrouwbare en wetenschappelijk betekenisvolle moleculaire docking analyse voor jouw onderzoek?
Ik bied moleculaire docking en proteinligand interactie analyse voor onderzoek in computationele biologie, geneesmiddelenontwikkeling, fytochemie, natuurlijke producten en gerelateerde velden.
Mijn diensten omvatten:
Moleculaire Docking
Proteïne- en ligandvoorbereiding
Moleculaire docking met AutoDock/AutoDock Vina
Binding affiniteit analyse
Evaluatie van docking pose
Interactie Analyse
Waterstofbruggen
Hydrofobe interacties
ππ en πalkyl interacties
Van der Waals interacties
Identificatie van belangrijke interactie-residuen
Resultaten & Visualisatie
Docking score/binding affinity tabellen
2D proteinligand interactie diagrammen
3D moleculaire visualisaties
Vergelijkende analyse van meerdere liganden
Klaar voor publicatie figuren
Ik kan ook Lipinski drug-likeness, ADMET, BOILED-Egg, toxiciteit voorspelling, moleculaire dynamica (MD), RMSD/RMSF en MM/PBSA analyse als aanvullende diensten leveren.
Ik heb onderzoekservaring in computational drug discovery, moleculaire docking, moleculaire dynamica simulaties en binding free-energy analyse, en ik focus op duidelijke, wetenschappelijk interpreteerbare resultaten.
Neem contact met mij op voordat je bestelt
Technologie:
MATLAB
Type analyse:
Kwalitatieve analyse
Expertise:
Experimentontwerp
Programmeertaal:
Python
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Wat heb je van mij nodig om te starten met de docking analyse?
Ik heb de structuur van het proteïne nodig (PDB ID/bestand), ligandstructuren (SMILES, SDF, MOL of PDB), en informatie over de bindingsplaats indien beschikbaar. Als je niet zeker bent over de bindingsplaats, neem dan contact met me op voordat je bestelt.
Welke docking software gebruik je?
Ik gebruik voornamelijk AutoDock/AutoDock Vina voor moleculaire docking en Discovery Studio, PyMOL en UCSF Chimera voor moleculaire interactie analyse en visualisatie.
Ontvang ik de docking resultaten en figuren?
Ja. Afhankelijk van het door jou gekozen pakket, kun je resultaten ontvangen zoals binding-affiniteit, interactie analyse, 2D interactie diagrammen, 3D visualisaties en vergelijkende tabellen.
Kun je natuurlijke producten of fytochemicals analyseren?
Ja. Ik kan fytochemicals, natuurlijke producten en andere kleine moleculaire verbindingen analyseren voor protein–ligand docking en interactie analyse.

