Ik analyseer rnaseq tijdreeksgegevens

Sommige informatie is automatisch vertaald.

Italië

Ik spreek Italiaans, Engels

3 bestellingen voltooid

Ik werk sinds 2015 in de bioinformatica. Ik heb ervaring met genoomassemblage en -annotatie, RNAseq-data-analyse van model- en niet-modelsoorten (met complexe experimentele ontwerpen), statistische da...
Over deze dienst

Heb je tijdreeksgegevens van een RNA-seq experiment met meerdere monsters, tijdstippen (en misschien condities?) en word je gek van het doen van pairwise vergelijkingen??? Ik kan een elegante en formele tijdsreeksanalyse bieden die tijd in de analyse verwerkt en die genen identificeert waarvan de expressie met de tijd verandert. Daarnaast kan ik deze informatie integreren met biologische databases, waardoor ik genen kan clusteren op basis van vergelijkbare temporele expressieprofielen en zoeken naar profielen die bestaan uit genen die tot dezelfde pathway of proces behoren.

Zo krijg je een biologisch inzicht in de tijdreeksdataset. Op maat gemaakte biologische databases kunnen ook worden gebruikt.

Programmeertaal:

R

Technologie:

Excel

Jupyter-notitieboek

Type analyse:

Kwantitatieve analyse

statistische analyse

Expertise:

Experimentontwerp

Trends

Algoritmes

wiskunde

Tools:

Overige

Gerelateerde tags