Ik ga bioinformatica data-analyse doen

Hoi allemaal,

Ik ben een bioinformaticus met specialisatie in transcriptomics data-analyse. Ik heb meer dan 10 jaar ervaring in het veld en werk met zowel model- als niet-modelsoorten, van slakken tot vissen tot mensen.

Ik ben vertrouwd met verschillende software en programma's die nodig zijn voor de bioinformatic analyse. Ik analyseer, visualiseer en help bij het schrijven van wetenschappelijke artikelen van hoge kwaliteit over Bioinformatics. Ik kan succesvol uitvoeren:

1. Data preprocessing (QC en trimming van reads)
2. Het mappen van je data op een genome of een referentie-transcriptome
3. Visuele inspectie van data door middel van PCA-MDS analyses
4. Differentiële genexpressie analyse in R met edgeR, DeSeq2 en limma
5. Gene clustering
6. Functionele analyses om biologische inzichten in je data te krijgen. Inclusief:

• Pathways analyse (bijvoorbeeld KEGG, DAVID)
• Gene Ontology analyse (bijvoorbeeld BP, CC, MF)
• Gene Set Enrichment Analysis met elk functioneel dataset
• Functionele analyses met aangepaste gen sets

Ik zou graag willen dat verkopers contact met mij opnemen om de projectdetails te bespreken.

Opmerking: Naast de bovengenoemde werkzaamheden kan ik meer doen (bijvoorbeeld de novo assembly van transcriptomen). Neem contact met mij op voor maatwerk opdrachten!