Ik doe bioinformatica analyse van rna seq single cell en tcga data

Bioinformatica engineer met 6 jaar ervaring in kanker genomica en meer dan 130 remote projecten sinds 2023 voor laboratoria, ziekenhuizen en biotech.

Wat ik analyseer

- Bulk RNA-seq: QC, differentiële expressie (DESeq2, limma), GO/KEGG/GSEA verrijking, WGCNA

- Single-cell RNA-seq: Seurat of scanpy clustering, annotatie, traject, cell-cell communicatie

- TCGA/GEO/CCLE publieke data: prognostische handtekeningen, Cox en nomogram, immuuninfiltratie

- Proteomics, DNA-methylatie, WES/WGS varianten, 16S en metagenomics, GWAS/PRS, multi-omics

- Machine-learning biomarker modellen (LASSO, random forest, XGBoost) met externe validatie

Wat je krijgt

- Publicatieklare figuren (volcano, heatmap, UMAP, KM-curve, forest plot, verrijkingsplots) in een consistente journalstijl

- Resultaat tabellen en reproduceerbare R/Python scripts

- Een methoden- en resultatenrapport dat je kunt plakken in een manuscript, plus hulp bij reviewer vragen

Hoe het werkt

Stuur je datatypes, monsterschema en de vraag. Ik reageer binnen 24 uur met een scope en vaste prijs, lever op tijd en houd je data vertrouwelijk (NDA welkom).

De analyses die ik heb gemaakt, worden gepubliceerd in eLife 2026 en Plant Biotechnology Journal.