Ik voer rna seq differentiële expressie en verrijkingsanalyse uit
Over deze dienst
Wil je je RNA-seq data laten analyseren maar heb je geen tijd of bioinformatica-kennis? Ik voer de volledige DESeq2 pipeline uit en lever publicatieklare resultaten zonder dat jij code hoeft te schrijven.
Wat ik aanbied:
Differentiële expressie-analyse met DESeq2 (de gouden standaard)
Publicatieklare figuren: volcano plots, PCA, heatmaps
GO & KEGG verrijkingsanalyse om de biologische betekenis van je genen te begrijpen
Duidelijke, overzichtelijke resultaten met interpretatie
Reproduceerbare R/Bioconductor code op aanvraag inbegrepen
Jij stuurt me alleen je raw count matrix + sample metadata. Ik regel de rest.
Mijn achtergrond: Ik combineer kennis van biologie met strenge computationele vaardigheden. Ik begrijp experimenteel ontwerp, biologische paden en waar reviewers op letten in een paper, niet alleen hoe je code runt.
Of je nu een masterstudent bent die je scriptie voorbereidt, een postdoc die snel een paper wil indienen, of een biotechbedrijf dat een target valideert, ik help je snel van raw data naar biologische inzichten.
Bekijk mijn portfolio voor een echt analysevoorbeeld (GSE150910, 288 longziekte samples).
Vragen? Stuur me een bericht voordat je bestelt. Ik reageer binnen enkele uren.
Programmeertaal:
Python
•
R
Technologie:
Excel
•
Jupyter-notitieboek
•
Overige
Type analyse:
Kwantitatieve analyse
•
statistische analyse
Tools:
RStudio
•
Google Colab
•
Microsoft Excel
•
Overige
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Wat heb ik nodig om te kunnen starten?
Een raw count matrix (genen als rijen, samples als kolommen) en een metadata-bestand waarin staat welk sample bij welke groep hoort. Als je niet zeker weet hoe je deze uit je sequencing data krijgt, stuur me een bericht — ik help je erdoorheen.
Ik weet niet of mijn data geschikt is voor DESeq2. Kun je dat controleren?
Absoluut! Stuur me eerst je data en ik doe een snelle kwaliteitscontrole voordat je bestelt. Als DESeq2 niet geschikt is, adviseer ik een betere aanpak.
Werk je met niet-menselijke data?
Ja! Ik kan RNA-seq data analyseren van muis, rat, zebravis, fruitvlieg, Arabidopsis en de meeste modelorganismen. GO/KEGG verrijking is beperkt tot organismen met annotatiedatabases.
Kun je de methodesectie voor mijn paper schrijven?
Ja, dit is inbegrepen in mijn Premium pakket. Ik lever een gedetailleerde methodenparagraaf die je direct in je manuscript kunt plakken.
Wat als ik na levering nog wijzigingen nodig heb?
Elk pakket bevat revisies (1 voor Basic, 2 voor Standaard, 3 voor Premium). Extra revisies kunnen als extra worden gekocht.

