Ik voer microbiële rna seq dge-analyse uit met deseq2 en snakemake

Welkom! Als PhD-onderzoeker in Biotechnologie & Microbiologie bied ik expertanalyse voor Microbial RNA-Seq data.

Ik doe niet alleen code uitvoeren; ik ben een gepubliceerde onderzoeker die de wetenschap achter jouw resultaten begrijpt. Mijn specialisatie is Differentiële genexpressie (DGE) en het identificeren van de belangrijkste up/down-gereguleerde genen voor jouw studie.

### Wat deze dienst biedt (RNA-Seq DGE)

Ik bied drie analyseniveaus aan op basis van mijn bewezen pipeline (FastQC, HISAT2, featureCounts, DESeq2). (Zie mijn FAQ hieronder over sampleaantallen!).

* Basis (De "Data"):

  Ik voer de volledige pipeline uit tot Read Counts (Stap 04). Dit pakket is perfect voor onderzoekers die R/Python gebruiken en alleen de uiteindelijke Counts Matrix nodig hebben.

* Standaard (De "Analyse"):

  Dit is de volledige DGE Analyse (Stap 05). Je krijgt alles uit Basic, PLUS alle belangrijke visualisaties: Volcano Plot, PCA Plot en Heatmap.

* Premium (De "PhD Inzicht"):

  Het volledige publicatieklare pakket. Je krijgt alles uit Standaard, PLUS: een volledig PDF-rapport met mijn deskundige Biologische Interpretatie (de "waarom") EN de reproduceerbare Jupyter Notebook die ik heb gebruikt voor jouw analyse.

**Neem contact met mij op voordat je bestelt om je project te bespreken.