Ik voer RNA-seq differentiële expressie en transcriptomics analyse uit
Medeoprichter van The Freelance Bubble LLC
Niveau 2
Voldoet aan hoge prestatiecriteria en heeft een bewezen staat van dienst in het voldoen aan de verwachtingen van de klant.
Zeer responsief
Geeft doorgaans uitzonderlijk snel antwoord
Over deze dienst
Bij The Freelance Bubble bieden we professionele RNA-seq en transcriptomics analyse voor onderzoekers, laboratoria, academische teams en biotech projecten die betrouwbare, reproduceerbare en publicatieklare resultaten zoeken.
Ons multidisciplinaire team brengt expertise in bioinformatica, genomica, moleculaire biologie, statistiek en wetenschappelijk onderzoek om projecten te ondersteunen van studieplanning tot biologische interpretatie.
Onze diensten omvatten:
- RNA-seq consultatie en projectbeoordeling
- Kwaliteitscontrole en preprocessing
- Count normalisatie
- Analyse van differentiële genexpressie
- PCA en sample clustering
- Heatmaps en volcano plots
- Genannotatie
- GO en pathway verrijkingsanalyse
- Functionele interpretatie van significante genen
- Publicatieklare figuren en tabellen
- R/Python scripts en reproduceerbare workflows
- Resultaatbeoordeling en presentatieondersteuning
We werken met R, Python, RStudio, DESeq2, edgeR, limma, Jupyter Notebook en gerelateerde bioinformatica tools.
Neem contact met ons op voordat je bestelt voor raw FASTQ verwerking, alignering, single-cell RNA-seq, grote cohorten of aangepaste pipelines.
Domein:
Machine learning
•
Overige
Programmeertaal:
Python
•
R
•
SQL
•
Colab
•
Overige
Technologie:
Python
•
R
•
Jupyter-notitieboek
•
Pandas
•
RStudio
•
Overige
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Welke soorten RNA-seq projecten ondersteun je?
We ondersteunen bulk RNA-seq en transcriptomics projecten met betrekking tot differentiële genexpressie, pathway-analyse, functionele verrijking, clustering, visualisatie en biologische interpretatie.
Kun je ruwe FASTQ-bestanden analyseren?
Ja, raw FASTQ verwerking kan worden ondersteund als een aangepaste workflow. Neem contact met ons op voordat je bestelt, omdat alignering, kwantificatie en grote datasets extra scope kunnen vereisen.
Welke hulpmiddelen gebruik je?
Afhankelijk van het project gebruiken we R, Python, RStudio, DESeq2, edgeR, limma, Jupyter Notebook en andere geschikte bioinformatica tools.
Voer je differential gene expression analyse uit?
Ja. We kunnen normalisatie, differentiële expressietests, fold-change analyse, significantiefiltering en visualisatie uitvoeren.
Kun je PCA, heatmaps en volcano plots leveren?
Ja. We bieden professionele visualisaties zoals PCA plots, clustering plots, heatmaps, volcano plots en andere relevante figuren.
Voer je pathway en verrijkingsanalyse uit?
Ja. Functionele verrijking, Gene Ontology en pathway analyse kunnen worden inbegrepen afhankelijk van het gekozen pakket.
Ontvang ik de broncode?
Ja. Reproduceerbare R- of Python-scripts/notebooks kunnen worden geleverd volgens de scope van het project.
Kun je helpen bij het interpreteren van de biologische resultaten?
Ja. We kunnen helpen bij het interpreteren van significante genen, verrijkte pathways, expressiepatronen en hun relevantie voor jouw onderzoeksvraag.
Bied je ook consultatie aan naast analyse?
Ja. The Freelance Bubble biedt zowel expertconsultatie als hands-on transcriptomics analyse, afhankelijk van je gekozen pakket.
Moet ik contact met u opnemen voordat ik bestel?
Ja, vooral voor raw FASTQ-bestanden, single-cell RNA-seq, grote cohorten, de novo transcriptomics, aangepaste pipelines of complexe experimentele ontwerpen.

