Door categorieën bladeren
Ontdekken
Fiverr Pro
Nederlands
$
USD
Ik voer RNA-Seq differentiële genexpressie analyse uit met edger of deseq
Bioinformatics Analist en Science Writer voor RNA Seq en NGS Data
Ik ben MS Bioinformatics student aan NUST met een BSc in Optometrie. Ik heb praktische ervaring in next-generation sequencing (NGS) data analyse. Mijn vaardigheden omvatten RNA-Seq analyse, differenti...
Over deze dienst
Ben je op zoek naar professionele RNA-Seq differentiële genexpressie analyse?
Ik voer volledige DGE-analyse uit op jouw count matrix data met behulp van edgeR of DESeq2 in R.
Wat je krijgt:
- Kwaliteitscontrole (PCA-plot en heatmap)
- Detectie en verwijdering van outliers
- TMM-normalisatie
- Differentiale expressie analyse
- Volcano plot met significante genen gemarkeerd
- Volledige resultaten CSV-bestand
- Samenvatting van upgereguleerde en downgereguleerde genen
Ik heb praktische ervaring met het analyseren van grote RNA-Seq datasets met honderden samples met behulp van edgeR en DESeq2 pipelines in R.
Neem contact met me op voordat je bestelt om je data en wensen te bespreken!
_gnhbnt.jpg)
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
In welk formaat moeten mijn gegevens zijn?
Ik heb een ruwe count matrix in .txt of .csv formaat nodig en een metadata bestand met samplegroep informatie.
Welke tool gebruik je edgeR of DESeq2?
Ik kan beide gebruiken, afhankelijk van jouw voorkeur. Beide geven betrouwbare resultaten voor RNA-Seq DGE analyse.
Wat krijg ik na de analyse?
Je ontvangt hoge resolutie figuren inclusief PCA-plot, heatmap en volcano plot, een CSV-bestand met alle resultaten, en een samenvatting van differentieel tot expressie gebrachte genen.
