Ik zal virtuele gen-knockout-resultaten analyseren met sctenifoldknk

Ik analyseer bestaande outputs van scTenifoldKnk en organiseer virtuele gen-knockout-Resultaten rondom jouw doelgen en celtype.

Het Basic pakket behandelt één doel en één celtype met behulp van jouw bestaande respons- of netwerken bestanden. Ik controleer identifiers, vat differentiële regulatie-resultaten samen en maak duidelijke grafieken en bewerkte tabellen. Vergelijkingen tussen meegeleverde seeds kunnen worden opgenomen als dit vooraf bij bestelling is afgesproken.

Je ontvangt resultaats-tabellen, figuren, het analyse-script en een README waarin de inputs en instellingen staan. Eén herziening is inbegrepen voor de afgesproken analyse.

Stuur alsjeblieft jouw doelgen, celtype-labels, bestaande uitvoerbestanden en de vraag die je beantwoord wilt hebben. Voor verrijking, lever de geteste genen en achtergrondlijst van genen aan.

Als je alleen een GEO-accession of een Seurat-object hebt, stuur me eerst een bericht: netwerkkkns-constructie en ruwe data-verwerking vallen onder een apart bereik. Ik gebruik waar passend AI-ondersteunde codering en controleer de code en outputs. Schriftelijke communicatie is welkom.