Ik analyseer rna seq en bioinformatica data voor biomedisch onderzoek
Biostatistiek
Over deze dienst
Ik bied reproduceerbare RNA-seq en genexpressie data-analyse met R en Python, met duidelijke interpretatie en publicatieklare visualisaties.
De diensten kunnen onder meer omvatten:
Differentiaal expressie analyse (DEG)
Volcano plots, heatmaps, PCA en andere visualisaties
GO en KEGG verrijkingsanalyse
GSEA padanalyse
PPI / gen interactienetwerkanalyse
GEO dataset ophalen en analyseren
Genexpressie en transcriptomica data interpretatie
Hoge resolutie, publicatieklare figuren
Georganiseerde resultaat tabellen en wetenschappelijke samenvatting
Afhankelijk van jouw data kan ik werken met count matrices, genormaliseerde expressiematrices, GEO datasets en andere standaard transcriptomica formaten.
De opleveringen kunnen onder meer bestaan uit figuren, Excel/CSV resultaat tabellen, analysetools, scripts en een duidelijk wetenschappelijk rapport volgens het gekozen pakket.
Neem contact met mij op voordat je een bestelling plaatst zodat ik je dataset, experimenteel ontwerp en onderzoeksvraag kan beoordelen en het juiste analysepakket kan aanbevelen.
Domein:
Natural language processing (NLP)
Expertise:
Classificatie
•
clustering
•
Voorspellende analyse
Programmeertaal:
Python
•
R
Tools:
Jupyter-notitieboek
•
CVAT
Technologie:
Python
•
R
•
SPSS
•
Excel

