Ik analyseer genomische sequencing data met bioinformatics tools

Sommige informatie is automatisch vertaald.
Zoe B

Verenigde Staten

Ik spreek Engels, Afrikaans

Ik analyseer genomische data met bioinformatics of maak je Excel data schoon

Hoi, ik ben Zoë, een onderzoeksspecialist in NGS Data Analysis. Ik werk met genomische en metagenomische data afkomstig van bacteriën, virussen en dieren. Ik gebruik bioinformatics tools, python, bash...
Lees meer
Over deze dienst

Neem eerst contact met mij op voordat je een bestelling plaatst zodat we de projectomvang, data-overdrachtsopties en leveringsverwachtingen kunnen bevestigen.


Ik bied genomische data-analyse van prokaryote WGS op maat van jouw onderzoek.

Met expertise in genomica en bioinformatics ontwerp en voer ik aangepaste pipelines uit om nauwkeurige en publicatieklare resultaten te leveren.


Diensten die ik aanbied

  • Kwaliteitscontrole & preprocessing van FASTQ-bestanden
  • Reads mappen op referentiegenomen (WGS)
  • De novo assemblage voor projecten zonder geschikt referentiegenoom
  • Variant calling & annotatie (SNPs, indels)
  • Metagenomische classificatie & microbiële profiling
  • Vergelijkende genomica en het genereren van aangepaste rapporten

️ Tools & expertise

  • Command-line interface (CLI) voor interactieve uitvoering en probleemoplossing van bioinformatics workflows
  • Bash scripting voor automatisering, reproduceerbare pipelines en high-throughput verwerking
  • HPC-omgevingen voor efficiënte grootschalige genome-analyse: AWS
  • Bioinformatics tools: BWA, SAMtools, BCFtools, FastQC, Roary, Prokka, RAxML
  • Referentiedatabases: NCBI, GenBank, CARD, VFDB


Wat jij levert:

  • Raw sequencing data (FASTQ-bestanden, gecomprimeerd indien groot)
  • Referentiegenoom
Lees meer
analyze genomic sequencing data with bioinformatics tools
Volledig scherm
analyze genomic sequencing data with bioinformatics tools

Technologie:

Python

•

Overige

Expertise:

Data-extractie

•

Datastroom

•

Gegevensmanipulatie

+1 meer

Gerelateerde tags