Ik lever volledige rna seq en differentiële expressie analyse
Over deze dienst
Werk je met RNA-seq of Microarray datasets en wil je betekenisvolle, statistisch robuuste genexpressieveranderingen halen? Als onderzoeker in computational biology, gespecialiseerd in genomics en transcriptomics, bied ik rigoureuze, end-to-end differentiële expressie analyse en systemenbiologie-workflows op maat van jouw onderzoek.
Of je nu ziekte mechanismen, medicijnbehandelingen of genetische verstoringen onderzoekt, ik transformeer je ruwe of verwerkte data matrices in publicatieklare figuren en uitgebreide analytische rapporten.
Programmeertaal:
R
Technologie:
Overige
Type analyse:
Kwantitatieve analyse
•
statistische analyse
Tools:
RStudio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Welke bestandsformaten heb je nodig om de analyse te starten?
Voor RNA-seq werk ik meestal met ruwe count matrices (CSV/TXT) of ruwe count tabellen. Voor Microarray data werken genormaliseerde expressiematrices of ruwe CEL-bestanden het beste. Voel je vrij om me te berichten als je niet zeker bent over je bestandsformaat.
Welke R-pakketten gebruik je voor de analyse?
Voor RNA-seq data gebruik ik robuuste Bioconductor-pijplijnen, vooral gebaseerd op DESeq2 (of edgeR op verzoek). Voor Microarray data gebruik ik limma. Voor netwerkanalyse gebruik ik STRING en Cytoscape.
Zijn de plots geschikt voor wetenschappelijke publicaties?
Ja! Alle visualisaties (volcano plots, heatmaps, PCA plots) worden in hoge resolutie (300+ DPI, PDF/PNG-formaten) gegenereerd met duidelijke labeling, waardoor ze volledig klaar zijn voor opname in onderzoeksartikelen, scripties of presentaties.
Kun je helpen bij het interpreteren van de biologische resultaten?
Zeker. Naast statistische tabellen en ruwe outputs, bied ik een duidelijk samenvattingsrapport dat de bevindingen uitlegt, belangrijke genen en pathway-enrichments in een biologisch betekenisvolle context.
Moet ik contact met u opnemen voordat ik een bestelling plaats?
Ja, ik raad sterk aan eerst een korte boodschap te sturen met je projectdetails en dataset-overzicht. Zo kunnen we het juiste pakket en de juiste aanpak kiezen voor jouw specifieke onderzoeksvragen.

